Nucleozide și nucleotide

Baza liberă este semnificativ mai puțin abundent în natură decât nucleozidele corespunzătoare și nucleotide. (fig. 34.8) Molecule nucleozidele sunt construite dintr-o bază purinică sau pirimidinică la care (-bond atașat carbohidrat (de obicei -riboza sau -dezoksiriboza) în N, respectiv poziția Astfel, ribonucleozid adenină (adenoza) și include adenină. - riboza, atașat în poziția guanoziniz guanina -ribozy și citozină la poziția tsitidiniz și riboză la poziția uridiniz uracil și riboză la poziția N și conexiune riboză -dezoksiribozy sau baza structurii inelare are loc datorită relativ acid GR Labi noy conexiune -glikozidnoy. zahăr reziduu teoretic și o purină (sau pirimidinice), baza se poate roti liber în jurul axei legăturii glicozidice, dar în realitate sunt sterice acest lucru. Conformația anti semnificativ mai preferat decât pentru nucleozide naturale (Fig. 34.9). O explicație detaliată a acestui fenomen veți găsi în Sec. 37. Aici vom spune doar că forma de anti este o condiție prealabilă pentru complementarea baze purinice și pirimidinice, în dublu-catenar molecula dezoksiribonu În formă acidă kleinovoy. (Deoarece D-riboza este prezentată în formă convențională în majoritatea figurilor și capurile, purinice și pirimidinice nucleozide și nucleotide sunt prezentate în -conformation mai puțin preferat.)

Structura 2-dezoxiribonu sunt bază purinică sau pirimidinică și -dezoksiriboza atașat la aceiași atomi

Fig. 34.7. Structura tautomerii citozină, timină. adenină și guanină, indicând formele predominante.

Fig. 34.8. Structura nucleozidelor ARN.

Fig. 34.9. Structura adenozinei sin și antikonfiguratsy.

Fig. 34.10. Acid Structura adenilic (AMP) (stânga) și acid 2-dezoksiadenilovoy (dAMP) (dreapta).

Fig. 34.11. Structura acidului uridylic (UMP) (stânga) și acid timidilic (TMP) (dreapta).

Nucleotidele - derivați de nucleozide fosforilate de către una sau mai multe grupări hidroxil ale riboză (sau deoxiriboză) (Fig. 34.10). Astfel, adenozin monofosfat (AMP sau ciclazei) construite din adenină, riboză și fosfat. 2-Dezoksiadenozinmonofosfat (dAMP sau dezoksiadenilat) este o moleculă constând din adenină, 2-dezoxiriboză și fosfat. De obicei uracilul este atașat la riboză la Timina-2-dezoxiriboză. De aceea, acidul timidilic (TSR) este compus din timină, 2'-dezoxiriboză și fosfat. și o parte a acidului uridylic (UMP) include uracil și riboza fosfat (Fig. 34,11). ADN-ul este un polimer al timidilic, dezoksitsitidilovoy-2, 2-dezoksiadenilovoy și acid 2-deoxyguanylic. ARN-ul este format de uridylic copolimerizare, policitidilic, acidul guanilic și adenilic.

În plus față de aceste forme de nucleotide și nucleotide a găsit structură neobișnuită. Astfel, în nucleotidul molecula ARNt identificat, în care riboza este atașat la uracil în poziția a cincea, adică. E. Nici o legătură azot-carbon și carbon-carbon. acest produs neobișnuit plus numit pseudouridine (y). moleculele de ARNt cuprind o nucleotidă și o altă structură neobișnuită - timina cuplat la ribozomonofosfatom. Această nucleotidă este formată după moleculă sinteza ARNt de reziduuri de metilare S-UMP adenosylmethionine (cm. Mai jos). Acid Psevdouridilovaya este de asemenea format ca urmare a transpoziției după sinteza UMP ARNt.

Nomenclatorul nucleozide și nucleotide

Poziția grupărilor fosfat din molecula de nucleotide este indicată cifre. De exemplu, adenozina este o grupare fosfat atașată la carbonul ribozei trebuie desemnate ca monofosfat. Barcode urmând cifrele dau să se distingă numărul atomilor de carbon în baza purinică sau pirimidinică din poziția atomului în reziduu (deoxi) riboză. Când numerotarea atomilor de carbon din bara de bază nu este pus. Nucleotida -dezoksiadenozin rest fosfat la carbon-5 o molecula de zahar este denumit 2-deoxiadenozină-5-monofosfat (Fig. 34,12).

Nucleozide care conțin adenină, guanină, citozină, timină și uracil, de obicei notate cu literele A, G, C, T și U, respectiv. Având pre-tăiate litera d indică faptul că componenta carbohidrat a nucleozidei este o grupare 2-dezoxiriboză. Guanozin cuprinzând -dezoksiribozu poate fi desemnat dG (dezoxiguanozin) și monofosfat corespunzătoare, o grupare fosfat atașată la atomul de carbon al treilea deoxiriboză, -dG-3-MP. De obicei, în acele cazuri în care fosfatul este atașat la 5-carbonul din riboză sau deoxiriboză, simbolul 5 este omisă. Astfel, guanozin 5-monofosfat, de obicei, notat cu GMP, 5-monofosfat 2'-deoxiguanosină abreviat DGMP. Dacă un rest carbohidrat atașat nucleozid 2 sau 3 reziduuri de acid fosforic.

Fig. 34.12. Structura 3 adenozin monofosfat (stânga) și 2-deoxiadenozină-5-monofosfat (dreapta).

Fig. 34.13. Structura ATP și formele di- și monofosfat corespunzătoare.

abrevierile folosite DP (difosfat) și TP (trifosfat). Astfel, adenozin trifosfat + trei grupări fosfat în poziția 5 a carbohidrat va fi notat ATP. structura ATP, precum și di- corespunzătoare și monofosfat este prezentată în Fig. 34.13. Deoarece moleculele sunt fosfații de nucleotide ca anhidridele acidului fosforic, t. E. Într-o stare cu entropie joasă, ele sunt numite macroergs (având o mare rezervă de energie potențială). Hidroliza de 1 mol de ATP la ADP este eliberat despre energia potențială.