factori de transcriere - chimist de referință 21

Chimie și Inginerie Chimică

Inițierea și reglarea transcripției ADN eucariot cu ARN polimeraza într-o măsură mai mare decât în ​​procariote. Depinde de multe alte proteine ​​- factori de transcripție care interacționează cu porțiuni discrete ale ADN-ului care formează un complex pro.motor eucariot. Regiunea promotor adiacent locului de inițiere a transcripției (site-PPC) detectat porțiuni cu secvențele de nucleotide caracteristice (), motive, care au un cis-acțiune asupra expresiei unei gene din apropiere. Aceste elemente pot interacționa cu polimerază ARN și alte proteine ​​de transcriere factori. Diferite proteine ​​factori de transcripție nucleară, care sunt proteine ​​de reglementare. capabile de legare la unul sau alte secvențe de ADN de nucleotide, astfel, exercitând o influență asupra expresiei diferitelor gene. Astfel de proteine. difuzabila [c.195]

Dezvoltarea organismelor eucariote pluricelulare se bazează pe capacitatea celulelor de a transfera între generații de stare activă sau, dimpotrivă, reprimate de gene. condiția genei moștenire în cele din urmă duce la formarea de țesut diferențiat, care constă din celule în care doar o mică proporție de gene activate în mijlocul parte reprimare principala a genomului. Studiul mecanismelor moleculare. furnizarea de moștenire gena activă sau inactivă într-un număr de generații de celule, este extrem de important. Se pare că, pe baza acestor mecanisme nu sunt doar interacțiune programabile de proteine ​​si ADN-ului, oferind ereditara organizarea cromatinei locale, dar, de asemenea, procesele de metilare ADN-ului. Metilarea poate .matrivat curse ca un mecanism special de control al transcripției, împreună cu mecanismele existente, pe baza interacțiunii dintre elementele care formează reglatoare care acționează cis și factori de transcripție. [C.218]

În ciuda setului personal de elemente de reglementare din gene structurale eucariote. fiecare dintre ele are regiunea promotor (TATA box. Hognessa sau cutie) opt nucleotide cuprinzând secvența TATA CCAAT secvență (caseta CAT), porțiunea din dinucleotida repetitivă G (OS-box). Aceste elemente sunt situate la o distanță de 25, 75 și 90 pb de situsul de inițiere, respectiv (fig. 3.23). Transcripția genei structurale eucariote începe cu legarea la factorul de transcriere software box TATA (TFIID), care este un complex de cel puțin 14 proteine. Apoi porțiunile TF1ID și ADN adiacente bind alți factori-side sous transcriere TATA, [c.46]

Astfel, regiunea promotorului eucariot este considerat ca o coloana vertebrala ADN specific. care reunește proteinele de transcriere care recunosc locurile lor de legare și interacționează între ele și cu ARN polimerază. Nu putem exclude faptul că factorii de transcripție sunt enzime în cursul acestor interacțiuni sunt efectuate ca o modificare enzimatică a factorilor de proteine. și ADN-ul. Apariția unui nou factor de transcriere în celulele diferențiate pot fi privite ca o modalitate de a încorpora gena pentru etapa de dezvoltare dorit. [C.201]

Trans actioneaza factori de transcripție care se leagă la elementele pro.motora ARN polimeraza I, nu a fost studiată. Mult mai mult este cunoscut despre structura și mecanismele de acțiune ale factorilor de transcripție proteinacee care interactioneaza cu ARN polimeraza III. [C.209]

Astfel, reglarea transcripției în eucariotelor este un proces foarte complex. Gena structurală poate avea o multitudine de elemente de reglementare. semnale specifice care sunt activate in celule de tipuri diferite la momente diferite ale ciclului celular. Cu toate acestea, unele dintre gene structurale sub controlul factorului de transcriere unic. Proteinele specifice pot interacționa cu anumite elemente de reglementare și blocarea transcripției sau se leaga cu tot complexul de inițiere a transcripției, înainte sau în timpul alungirii transcriere. [C.47]

Fig. 9-67. Unele complexe stabile. factori de transcripție formate cu gene eucariote. Culoarea neagră indică o anumită secvență de ADN care este considerată a fi necesară pentru funcționarea fiecărui promotori de gene au culoare evidențiate zone care aproape „se alătură factori (pe baza datelor ADN footprinting, vezi. Fig. 4-69). Factori de transcriptie sunt molecule proteice . care poate consta din mai multe subunități, deși structura unora dintre acești factori nu este cunoscută. aceste numere se referă la poziția de pe molecula de ADN (în perechi de nucleotide) în raport cu site-ul de start granskriptsii,

Aparent, polimeraza ARN-ul este capabil de a adera în mod corespunzător la promotorul numai sub forma de golofermenta completă. Acesta este compus din subunități a, P, (3a și u. În absența factorului sigma ușor separabile (a) enzima are o activitate catalitică maximă. Dar nu sunt capabile de legare la o anumită porțiune a unui promotor ADN. Acest factor de transcripție (sigma) joacă probabil un rol important în aderarea specific ADN-polimerazei. [c.481]

În eukariote vscheleny și caracterizate ca cinci proteine ​​de reglementare. factori de transcripție (TF botezate PA, PX, The lld a, si NU IIF). Acestea sunt necesare pentru ADN-ul site-ul de recunoaștere (site), numit TATA (pe secvența ensus TATAAAA). Mecanismul molecular de acțiune detaliat de factori de transcriere nu este încă dezvăluită. [C.539]

Două cazuri sunt cunoscute, atunci când expresia off anumitor gene, și includerea altor datorită înlocuirii sig-ma-factor. Una dintre aceste fenomene-sporulare. sau -consists sporulație în modificări morfologice ascuțite care transporta bacteriile din formele latente (spori), capabile să supraviețuiască în condiții adverse. Un alt fenomen observat în timpul infecție celulele bacteriofag litice. În cazul în care infecția se dezvoltă în acest fel, în cele din urmă, ca urmare a multiplicării fagului celulei moare. În toate cazurile, cea mai ușoară dezvoltarea fagului switch-uri de transcriere. Cu toate acestea, este cunoscut doar un singur caz bine studiată în cazul în care modificările datorate înlocuirii specificității transcriptie a factorului de celule-sigma pe fagul. (Se găsește în bacterii, capabilă să formeze spori.) Majoritatea modificărilor apar sub acțiunea altor mecanisme cu factori de transcripție -De obicei suplimentari. Se pare că mecanismul de reglementare. bazată pe apariția modificărilor în majoritatea polimeraza ARN, utilizat fără tragere de inimă de celulă, și numai ca ultimă șansă. Este probabil ca abilitatea de a utiliza interschimbabil fiecare alți factori sigma sunt doar a apărut evoluționar într-un interval foarte limitat de bacterii. [C.157]

La activitatea de transcripție a ADN-ului este judecat prin interacțiunea cu ARN polimerază. Când se compară moleculele de ADN care au fost incubate în prealabil cu factorii de transcripție, sau molecule care nu au fost supuse unui astfel de tratament. Sa constatat că ARN polimeraza utilizează cu ușurință pentru sinteza moleculelor de ADN ARN asociate [c.146]

Mecanismele moleculare. prin care elementele promotor descrise regla transcrierea, nu a fost încă clarificat, dar este sigur că activitatea de elemente promotor datorită legării factori proteici specifici. asigurând transcrierea și eficientă a genei prin ARN polimeraza P. Obținută diferite proteine ​​care interacționează cu diferite porțiuni ale promotorului care conține un TATA, CCAAT sau G -motivg. Aparent, există mai multe proteine ​​capabile de legare la CCAAT motiv. printre ei - heterodimerul. compus din diferite subunități. Proteina, invata G -motiv. Se leagă la porțiunea de ADN care cuprinde 18-20 n. N. în centrul căruia este un element al lui G. Eficacitatea promotorului, cel puțin parțial, determinată de eficiența unui promotor element separat (motiv) în compoziția, numărul acestor elemente și dispunerea reciprocă a acestora. Aceste elemente sunt susceptibile de a opera în funcție de mediul următor nucleotidă. Înlocuire nucleotide din apropiere pot afecta foarte mult eficiența elementului. Astfel, de exemplu, substituții de nucleotide în caractere aldine înconjurat -motiva G (GGGG GGGG) poate reduce activitatea promotorului. în timp ce înlocuirea primului G pe T este destul de acceptabil. Dacă regiunea conține atât promotorul și elementele G. CAAT, diferiți factori de proteină transcripționali interacționează cu acestea, se poate activa transcrierea in concert. [C.199]

Acesta a alocat zonele A și B. linie ondulată secvență necesară pentru exprimarea diferitelor gene care codifică proteine ​​induse sub șoc termic marcat. Genele, care sunt atașate la această porțiune a promotorului, incepe sa exprimat in mod activ sub șoc termic. Regiunile promotor A și B ale genei soc termic Drosophila sunt subliniate chetyrehnukleotidnye motive repetitive T G și GTT. Disponibilitatea zonei B este necesară pentru exprimarea completă a genei. Elementele A și B interacționează cu factorii de transcripție de proteine ​​au proprietăți funcționale similare și au un efect sinergic. activarea transcrierii. gene de soc termic Drosophila sunt introduse în celule de mamifere. începe exprimat în mod activ la temperaturi mai ridicate. Acest lucru sugereaza ca nu numai genele de șoc termic. dar componentele de reglementare ale sistemelor de gene sunt destul de conservatoare în evoluție. [C.200]

Principiile de acțiune ale amplificatori. capabil să își exercite influența pe o distanță considerabilă (mai mult de o mie de perechi de baze), și indiferent de orientarea în ceea ce privește începutul transcriere nu este înțeles. blocuri de nucleotide scurte pot servi ca site-uri de legare ale proteinelor nucleare specifice. care acționează ca factori de trans-acțiune. Puterea amplificatorului. Aceasta poate depinde, probabil, de numărul de astfel de blocuri (module). Vom discuta aceste două mecanisme majore de acțiune ale amplificatori. Se crede că porțiunile funcționale ale genomului care conține una sau mai multe gene. formează bucle lungi, care cuprinde mii de perechi de nucleotide de ADN. Acesta și-a exprimat opinia că buclele sunt fixate în matricea nucleului celulei și pot fi sverhspira-calized. Compoziția include o matrice și topoizomeraza este aparent în spatele unui ADN unic topologie buclă (vezi. Cap. KP), într-un astfel de caz, cu be.1kami interacțiune intensificator poate altera conformația întreaga buclă, inclusiv la distanță din segmentul de ADN enhancer, rezultând în care compoziția variază buclele structurii cromatinei locale și transcrierea genei este facilitată (Fig. 112,6). Este mult mai probabil ca efectul amplificatorului. legat de o proteină determinată prin directa polimeraza ARN al vzai.chodeystviem și alți factori de transcripție in procesul initsiatsii- O astfel de interacțiune se poate datora îndoirea unei molecule de ADN, ceea ce creează posibilitatea promotor directe zone de contact și un amplificator de la distanță de la el. asociate cu proteine ​​specifice (Fig. I2, c). [C.204]

Transcripția genelor 5S ARN și tRNA se realizează cu proteine ​​factor de transcripție izolate și purificate este factorul de transcripție deosebit de bine studiat specifice TF P1 A (Engl. Trans ription fa tor) 55 gene. Factorul este o polipeptidă cu L1, TOV = 40, comunică cu gena internă elementul de control 55. El a fost urmat de alte doua proteine ​​se leagă și se alătură ARN polimerazei. Una dintre caracteristicile proteinei TF P1 A constă în faptul că se leagă în mod specific, nu numai ADN-ul, dar, de asemenea, cu ARN 5S. Prin urmare, la concentrații mari [c.210]

Fig. 3.24. Inițierea transcripția genei structurale a eucariotelor. Tigo primul factor de transcriere se leagă la caseta TATA. atunci are loc aderarea alți factori de transcripție și ARN polimeraza II și, în final, factori auxiliari declanșează transcripție. Arrow - direcția de transcriere.

gena Block expresie nu poate, se realizează numai prin utilizarea unei terapii antisens, dar, de asemenea, introducerea în celulă a unei oligonucleotide care se leagă la un factor de transcriere sau o emisiune, dar această abordare nu a fost studiată în mod adecvat. Mai mult, deoarece acizii nucleici sunt capabili de a se lega la proteinele pot fi sintetizate astfel de oligonucleotide (numită aptamer), care va fi atașat la o anumită proteină. în mod normal, nu sunt asociate cu oricare dintre acizii nucleici. și blochează funcția sa. Deci, antitrombina aptamer poate fi un mijloc de low-cost de prevenire a formării de trombi în diverse vmeschatelstvah chirurgicale. [C.508]

factor de transcriere (Trans ription tor fa) O proteina care ajuta ARN polimeraza pentru a trece toate etapele de transcripție și asigurând selectivitatea procesului. [C.562]

Mai mult, formarea de complexe de inițiere eucariotă necesită proteine ​​speciale inițiator numite factori de transcripție, în general. Să luăm în considerare unele dintre ele în raport cu sinteza ARNm. Acestea includ o proteină de legare TATA sau TSB, și 8-10 proteine ​​asociate cu TBS. Ele sunt numite asociate TSB factori, băi sau TAF. TSB și PAF TFPD formează un complex, sau un factor de transcriere Drdya ARN polimerazei II. [C.459]

Există unele motive să credem că este necesar să se activeze gena încălcare a structurii cromatinei. factor de transcripție a genei 5S-PHK nu activeaza gene in vitro, în cazul în care acestea sunt în complex cu histonelor. Cu toate acestea, acest factor poate forma complexul necesar cu ADN liber, urmată de adăugarea de histo [c.392]

După cum levigare remarcat, ARN polimerazele eucariote nu recunosc promotorii lor pe molecule de ADN purificate. Pentru ca acest lucru să se întâmple, ADN-ul ar trebui să contacteze una sau mai multe proteine ​​specifice site-ului. Astfel de proteine ​​numite factori de transcripție (TF). Ele se deosebesc de factorii procariote sigma (a-factori), care se pot lega la ADN, indiferent de ARN polimerază. Polymerase I, II și III necesită prezența diferiților factori transcripționali identificați TF1, TFD și respectiv TFIII. litere latine, care este, de obicei, urmat de un număr roman în titlul factorului de transcriere indică modul în care a fost evidențiat în contul acestui factor. De exemplu, TFIIIA - caracterizat primul factor de transcriere care afecteaza gena transcrisă polimerazei III (gena 5S-pPHK). [C.146]

Aparent, factori de transcripție in vitro formează un complecși transcripționale destul de stabile. care atrag în mod selectiv molecule de ARN polimerazei pentru promotorii săi. Diferiți factori sunt atașate la ADN în diferite locuri în ceea ce privește prevederile de început a transcripției. 1 polimerază și polimeraza II complex cu factorul de transcripție care se leagă direct la situsul de start al transcripției. Int> factorul de transcripție primar pentru gene polimeraza citibil III, ADN-ul se alătură direct în spatele situsul de start al transcripției și, astfel, ARN polimeraza III trebuie să își îndeplinească funcția fără deplasarea proteinei din ADN-ul (fig. 9-67). Se crede că vânturile ADN acest factor (TFIII) pe ea însăși, formând particule o mare nucleoproteină -vuyu. [C.146]